Enligt företagets huvudförtroendeman börjar uppsägningarna verkställas omedelbart.
Företaget säger upp 52 personer, varav en tjänsteman.
Samarbetsförhandlingarna, som började i juni, omfattade uppsägningar av högst 90 personer.
Företaget, som tillverkar jordbruksmaskiner, har länge klarat av att gå mot strömmen i teknologibranschen och till och med anställt mera personal.
Förra året byggde Agco ut en dieselmotorfabrik i Nokia för 25 miljoner euro.